秦鹏飞，2023，《传统父系宗族中“族”的意义：以九族亲属制度的建构为例》，《社会》第1期。

秦鹏飞、宣朝庆，2023，《礼与俗的社会伦理基础：以传统祭礼为中心的讨论》，《民俗研究》第1期。

秦鹏飞，2022，《“差序格局”概念的分析路径：以费孝通对公私问题的分析为例》，《中国农业大学学报》（社会科学版）第6期。

秦鹏飞，2020，《“祭祀不祈”与“内尽己心”：以儒家祭礼中的鬼神为例论儒家思想的“理性主义”》，《社会》第3期。

秦鹏飞，2020，《儒家思想中的“关系”逻辑：“伦”字界说与内在理路》，《社会学研究》第1期。

秦鹏飞，2019，《“服从”与“尊贤”：对“君为臣纲”的两种理解路径》，《社会理论学报》第2期。

秦鹏飞，2016，《“外来者”的忧虑：对董时进乡村建设思想的反思》，《社会发展研究》第4期。

2022国家社科基金青年项目“农村基层治理共同体的思想渊源和实现机制研究”，负责人，在研。

2020年中国博士后面上资助项目“高风险时代的政商关系研究：以1903-1928年间的天津晋商为中心”，负责人，在研。